O MapBiomas Amazônia envolve pesquisadores e especialistas em sensoriamento remoto, informática, ecossistemas e uso do solo de cada um dos países participantes (Bolívia, Brasil, Colômbia, Equador, Peru e Venezuela). A equipe trabalha em seus escritórios nacionais e laboratórios sob estreita coordenação internacional. Todo o trabalho é feito usando computação em nuvem por meio da plataforma Google Earth Engine.